L'acupuncture est une technique délicate et dont une mauvaise pratique, comme pour toute intervention médicale ou para-médicale, peut avoir des effets nocifs, par exemple si les aiguilles ne sont pas stériles, inadaptées ou appliqués dans des zones sensibles.

Certains praticiens ne recourant pas à la stérilisation (ou utilisant des stérilisations « alternatives ») peuvent transmettre des infections entre les patients, de la même façon qu'avec des aiguilles de seringues si elles étaient utilisées plusieurs fois ; contre ce problème, en Occident on utilise en général des lots d'aiguilles à usage unique.